在將細(xì)胞作為自己歷史的策展人的研究中,Dana-Farber癌癥研究所的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),成體組織保留了記憶在其DNA上的記憶,這些記憶來自它們產(chǎn)生的胚胎細(xì)胞。這一發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致了一個(gè)更有趣的 - 記憶是完全可以檢索的:在某些條件下,細(xì)胞可以反向發(fā)揮其發(fā)育的故事,以開啟在胎兒狀態(tài)中活躍的基因。
“分子細(xì)胞”雜志今天在線發(fā)表的研究結(jié)果推翻了普遍的科學(xué)假設(shè),即成體組織幾乎沒有胚胎起源。該發(fā)現(xiàn)尤其與再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān),因?yàn)樗砻鱽碜曰颊叩募?xì)胞可被誘導(dǎo)進(jìn)入發(fā)育的早期階段,然后允許成熟為可用于替代患病或衰竭器官的成體組織。它也有望用于癌癥研究,尤其是癌細(xì)胞激活長(zhǎng)期未使用的基因以幫助它們?cè)谌韨鞑サ哪芰Α?/p>
“我們發(fā)現(xiàn)成體細(xì)胞保留了早期發(fā)育中使用的所有基因的目錄 - 這是胚胎內(nèi)器官和組織形成階段的記錄,”新研究的高級(jí)作者Ramesh Shivdasani說。醫(yī)學(xué)博士,Dana-Farber,布萊根婦女醫(yī)院,哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛干細(xì)胞研究所。“除了這個(gè)存檔的純粹存在,我們驚訝地發(fā)現(xiàn)它不會(huì)被永久地鎖定,但在某些條件下可以被細(xì)胞訪問。這一發(fā)現(xiàn)對(duì)于我們?nèi)绾慰创?xì)胞能力以及未來治療退行性疾病和其他疾病,具有潛在的深遠(yuǎn)意義。“
Shivdasani及其同事發(fā)現(xiàn)的“胚胎記憶”采用稱為甲基的分子形式,與細(xì)胞內(nèi)的DNA結(jié)合并脫離。這些甲基的位置 - 它們與DNA結(jié)合的部分和數(shù)量 - 確定哪些基因是活性的,哪些不是。在給定DNA部分中甲基的排列稱為甲基化模式。
在這項(xiàng)新研究中,研究人員專注于稱為增強(qiáng)子的DNA區(qū)域的甲基化模式。增強(qiáng)子可以被認(rèn)為是打開和關(guān)閉基因的關(guān)鍵。為了激活基因,DNA形成一個(gè)環(huán),使增強(qiáng)子靠近基因的編碼部分 - 包含制造蛋白質(zhì)藍(lán)圖的部分。然后,與DNA和特化蛋白質(zhì)的其他區(qū)域一起,嵌入DNA中的遺傳密碼被轉(zhuǎn)換成RNA。
Shivdasani解釋說,在胚胎和胎兒發(fā)育的過程中,隨著細(xì)胞逐漸發(fā)展成為數(shù)百種成體組織的特定特征,細(xì)胞“不斷地選擇它們將變成什么樣的細(xì)胞”。“這個(gè)過程被稱為細(xì)胞分化,涉及細(xì)胞使用不同的增強(qiáng)子打開和關(guān)閉不同的基因。”在每個(gè)發(fā)展階段,特定的增強(qiáng)器組變得活躍,就像管弦樂隊(duì)的各個(gè)部分在交響樂的不同部分中發(fā)揮作用一樣。
當(dāng)孩子完全成形時(shí),這組活躍的增強(qiáng)劑在其余的生命中基本保持不變(例如,肝臟隨著孩子的成長(zhǎng)而變大,其作為肝臟的身份是一致的)。Shivdasani說,在大多數(shù)情況下,在開發(fā)早期使用但現(xiàn)在閑置的增強(qiáng)劑“看起來已被關(guān)閉”。“他們似乎沒有活動(dòng)的特征。”
增強(qiáng)子的一個(gè)顯著特征是它們的某些部分 - 遺傳密碼的C分子后面跟著G分子 - 大部分是甲基,這種狀態(tài)稱為低甲基化。甚至在他們?cè)谂咛グl(fā)育中的作用結(jié)束后被關(guān)閉的增強(qiáng)劑也是如此。然而,科學(xué)家并不知道細(xì)胞如何廣泛地保存它們最早的化身,以及這些記憶是否可以被訪問。
新研究的結(jié)果在兩個(gè)方面都很有啟發(fā)性。在來自成年小鼠的腸細(xì)胞中,Shivdasani和他的同事發(fā)現(xiàn)了一個(gè)幾乎完整的增強(qiáng)子檔案,這些增強(qiáng)子在腸道發(fā)育的形成階段很活躍。此外,他們發(fā)現(xiàn)在沒有稱為Polycomb Repressive Complex 2(PRC2)的蛋白質(zhì)的情況下,大多數(shù)這些封閉的增強(qiáng)子在兩周內(nèi)恢復(fù)活動(dòng)。(PRC2是細(xì)胞用于關(guān)閉特定基因的主要蛋白質(zhì)之一。)
“我們發(fā)現(xiàn),成年細(xì)胞不僅能保留胚胎和胎兒期的記憶,而且在某些情況下,這種記憶可以恢復(fù),”Shivdasani說。“存檔安全存儲(chǔ),可以非常特殊和準(zhǔn)確地召回。”
在這一點(diǎn)上,研究人員只能推測(cè)成體細(xì)胞保存這些分子記憶的原因。一種可能性是它們只是細(xì)胞譜系早期階段的遺物 - 它們發(fā)育過程中的化石。另一個(gè)原因是,細(xì)胞可能需要召喚這些記憶 - 實(shí)際上將它們帶入生命 - 以產(chǎn)生新的組織來修復(fù)損傷。“如果身體需要再生受損的組織,那么該組織內(nèi)的細(xì)胞可能需要重播胚胎中發(fā)生的事情,”Shivdasani說。
研究作者表示,這項(xiàng)研究結(jié)果可能為再生醫(yī)學(xué)開啟了新的篇章,因?yàn)榭茖W(xué)家正在研究是否可以利用細(xì)胞記憶為受損或患病的器官產(chǎn)生替代組織。由于這種組織來自患者自身的細(xì)胞,因此不存在免疫系統(tǒng)排斥的風(fēng)險(xiǎn)。
這一發(fā)現(xiàn)也可能為癌癥治療帶來希望。人們認(rèn)為,癌細(xì)胞獲得離開原始腫瘤和轉(zhuǎn)移的能力的方法之一是通過開啟在胎兒發(fā)育期間活躍但后來變?yōu)樾菝叩幕?。知道?xì)胞記錄他們?cè)?jīng)活躍的增強(qiáng)劑可能會(huì)提出新的治療目標(biāo),旨在阻止或預(yù)防患者的轉(zhuǎn)移。
該研究的主要作者是Dana-Farber,Brigham and Women's和哈佛醫(yī)學(xué)院的Unmesh Jadhav博士。共同作者是Dana-Farber和哈佛醫(yī)學(xué)院的Huafeng Xie博士;Dana-Farber的Nicholas K. O'Neill,Zachary Herbert,MS和Shariq Madha;Dana-Farber,Brigham and Women's和哈佛醫(yī)學(xué)院的Alessia Cavazza博士和Kushal K. Banerjee;諾華生物醫(yī)學(xué)研究所的Veronica Saenz-Vash和Huili Zhai博士;和Dana-Farber博士,哈佛醫(yī)學(xué)院霍華德休斯醫(yī)學(xué)院和哈佛干細(xì)胞研究所的Stuart Orkin博士。
該研究得到了美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院的支持(授予R01DK081113,R01DK082889,U01DK103152,F(xiàn)32DK103453,K01DK113067和P50CA127003);Dana-Farber癌癥研究所 - 諾華藥物發(fā)現(xiàn)計(jì)劃;意大利美國(guó)癌癥基金會(huì)的獎(jiǎng)學(xué)金;和Lind家庭的禮物。