這可能是一部充滿間諜活動的戰(zhàn)時驚悚片,或者是陪練柔道大師的吹噓。但相反,它是微生物之間分子戰(zhàn)的真實故事,從病毒闖入細菌并注射其DNA開始,這是感染的第一步。
一個世紀以來,科學家已經(jīng)知道病毒會攻擊并有時會殺死細菌,就像人類感染流感一樣。但直到最近,他們才開始了解隨著細菌和病毒爭取競爭優(yōu)勢而發(fā)生的生物化學,對醫(yī)學產(chǎn)生深遠的影響等等。
十年前,“沒有人認為細菌具有復雜的適應性免疫系統(tǒng),”蒙大拿州立大學文學與科學學院和農(nóng)業(yè)學院微生物學和免疫學系副教授Blake Wiedenheft說。
然而,從那以后,研究人員發(fā)現(xiàn)了一種細菌利用機器分子檢測和摧毀入侵病毒的機制。這種免疫反應被稱為CRISPR,這是一個縮寫,描述了細菌如何將病毒DNA片段整合到自己的基因組中,作為未來識別和對抗病毒的一種方式。
對于國際公認的該領(lǐng)域?qū)<襑iedenheft而言,不斷增長的CRISPR知識引發(fā)了其他問題:病毒是否找到了破壞細菌防御的方法?如果是這樣,怎么樣?
“病毒是強大的,”Wiedenheft說。“而且我們開始了解他們已經(jīng)發(fā)展起來的策略的創(chuàng)造性曲目,以逃避檢測,但他們的主人。”
Wiedenheft在3月11日發(fā)表于Molecular Cell期刊的一篇科學論文中發(fā)表了他的團隊最新發(fā)現(xiàn),不僅描述了CRISPR防御的新細節(jié),而且還發(fā)現(xiàn)了擴大科學家對資源豐富病毒的理解的發(fā)現(xiàn)。
使用強大的電子顯微鏡和尖端的圖像處理技術(shù),Wiedenheft和他的合作者,斯克里普斯研究所的副教授Gabriel Lander,可以看到一個復雜的CRISPR分子通過展開Wiedenheft比作“燈塔”的分子臂來響應病毒DNA。Lander和Wiedenheft是該論文的主要合著者。
Wiedenheft解釋說,燈塔就像“發(fā)出危險信號的紅色閃光燈”,作為其他CRISPR分子的生物化學線索來摧毀病毒。
當研究人員意識到燈塔類似于已知病毒產(chǎn)生的蛋白質(zhì)時,出人意料。這場比賽不太準確。
“似乎病毒已經(jīng)偷走了燈塔并將其用作誘餌,”Wiedenheft說道。換句話說,通過將信標樣蛋白質(zhì)的分子釋放到細菌中,病毒可能混淆CRISPR警報信號。“這很精彩,也很狡猾。”
Wiedenheft說:“這一發(fā)現(xiàn)表明,病毒可能通過借用(CRISPR)免疫系統(tǒng)本身并重新部署它們來抵抗免疫反應來發(fā)展反抗。”
這并不是Wiedenheft團隊第一次發(fā)現(xiàn)這種病毒顛覆。2014年,他的團隊和一組國際同事發(fā)表了一篇論文,表明所謂的“抗CRISPR”可以通過一系列策略阻斷細菌免疫系統(tǒng)。2017年,他們發(fā)表的結(jié)果顯示,另外兩種抗CRISPR阻止免疫系統(tǒng)識別病毒,無論是通過模仿DNA還是像堵塞病毒監(jiān)測機器的粗糙楔子一樣。
Weidenheft表示,最新發(fā)現(xiàn)的重要性在于它是第一例觀察到模仿真實CRISPR蛋白的病毒。
根據(jù)Wiedenheft的說法,關(guān)于病毒是否“偷走”信標 - 即直接占用它 - 或者它是否獨立進化,這是一個懸而未決的問題。
Wiedenheft說:“接下來,我們想直接測試這種進化假設,”看看病毒是否可以被捕獲。
Wiedenheft說,如果他們在這方面取得成功,它將為在實驗室中制造抗CRISPR的可能性提供可能,這可能對醫(yī)學產(chǎn)生重大影響。病毒已經(jīng)被用作抗生素抗性細菌的替代療法,并且設計它們克服天然CRISPR防御的能力可以進一步幫助治療有害細菌。